Может не все отличия, но то что я быстро вспомнил и нашёл.

1. Над Umbraco работает группа разработчиков, Mojoportal создал и развивает один человек. 
2. У Umbraco много модулей, которые необходимо доустанавливать. Mojoportal, по умолчанию, запакован по максимуму.
3. Модули Umbraco пишутся разными людьми.
4. Обучение и поддержка на Umbraco платная. У Mojoportal поддержки как таковой нет. (Есть отличная документация и оперативный ответ разработчика на форуме). 
5. Mojoportal проще в работе.
6. По функционалу: все стандартные инструменты присутствуют в обеих системах.